AutoClickExtreme - автокликер в помощь

Можно ли, что б эта программа работала в браузере, а ты в это время занимался своими делами на компьютере (играть, смотреть фильмы, работать в другом браузере).
Всмысле что б она тебя вообще никак не касалась, работала сама по себе и ничем не мешала.

установил я virtualbox, а как пользоваться не знаю... там ещё винду устанавливать нужно?

да. это будет винда в винде.